Президент Российской Федерации Владимир Владимирович Путин, совместно с членами Правительства, руководителями ведомств и муниципалитетов, провел совещание в городе Братск о ликвидации последствий паводка в Иркутской области, также глава государства посетит пострадавшие районы.
Минздрав России с первого дня возникновения чрезвычайной ситуации на территории Иркутской области держал ситуацию под контролем.
28.06.2019 были командированы 2 эксперта Минздрава России: специалист медицины катастроф и инфекционист.
По поручению Министра здравоохранения Российской Федерации В.И. Скворцовой, 01.07.2019 в зону чрезвычайной ситуации был направлен сводный медицинский отряд ФМБА России во главе с руководителем В.В. Уйба для хирургической помощи жителям Нижнеудинского района и вакцинации населения труднодоступных населенных пунктов Тулунского района, дважды командировался заместитель Министра здравоохранения Российской Федерации С.А. Краевой и 17.07.2019 в г. Тулун для организации проведения судебно-медицинских экспертиз направлен главный судебно-медицинский эксперт Министерства здравоохранения России А.В Ковалев.
Ежедневно осуществлялся мониторинг ликвидации медико-санитарных последствий.
В пунктах временного размещения и пунктах длительного пребывания было организовано круглосуточное дежурство медицинских работников (врачей, фельдшеров), медицинских психологов. Вопросы льготного лекарственного обеспечения взяты на особый контроль. Пострадавшие территории полностью обеспечены лекарственными препаратами, потребность закрыта на 3 квартал 2019 г.
В медицинских организациях был создан 10-дневный оперативный запас лекарственных препаратов и медицинских изделий, продуктов питания, питьевой воды, имеются источники бесперебойного электропитания.
В населенных пунктах, пострадавших от паводка, работают 27 бригад скорой помощи, включая 23 наземных и 4 санитарных вертолета ТЦМК, а также Сводный медицинский отряд ФМБА России из 30 человек, 6 единиц техники (2 операционных модуля, 2 реанимационных модуля, 1 перевязочная и 1 штаб-диспетчерская).
Уровень заболеваемости в подтопленных территориях не превышает среднестатистических показателей по Иркутской области. Групповых и вспышечных инфекционных заболеваний не зарегистрировано.
Организована доставка всех полученных вакцин в районные больницы вертолетами. Охвачены все основные группы риска по эпидпоказаниям. Работают 44 прививочные бригады Иркутских медицинских работников и 8 бригад ФМБА (для вакцинации в труднодоступных и удалённых районах – Октябрьский-2, Уйгад, дер. Кривуша). 
Министерством здравоохранения Российской Федерации направлены письма в МЧС России и Минстрой России от с просьбой рассмотреть обращение Губернатора Иркутской области по вопросу выделения дополнительных бюджетных ассигнований на восстановление медицинских объектов, разрушенных в результате чрезвычайной ситуации.